Kebudayaan dalam ensiklopedia ini meliputi tradisi lisan, toponimi termasik geosite, mata pencaharian, dan daur hidup. Meskipun ada lagi tema lain yang penting dalam kebudayaan, keempat tema ini dapat mewakili kebiasaan hidup masyarakat yang secara turun-temurun sebagai warisan budaya leluhur yang ada di Kawasan Danau Toba (KDT) atau Kawasan Geopark Kaldera Toba (KGKT). Materi kebudayaan ini dikumpulkan dan disusun oleh 20 orang kontributor tulisan yakni 4 orang dari setiap pemilik kebudayaan itu sebagaimana yang terlihat pada sampul dalam ensiklopedia ini. Materi kebudayaan ini diambil dari berbagai sumber seperti wawancara dari informan,sumber tertulis dari media cetak, dan media elektronik.