Pelaksanaan pemugaran Bekas Kota Kerajaan Majapahit telah berjalan kurang lebih dua belas tahun. Dari sejumlah 16 situs yang direnanakan dalam buku Rencana Induk Arkeologi hingga saat ini baru 6 situs yang sudah ditangani. Keenam situs tersebut adalah Kolam Segaran (198311984), Candi Tikus (1984/1985 - 1988/1989), Gapura Bajangratu (1985/1986-1991/1992), Situs Pemukimanan Sentonorejo (1991/1992), Candi Brahu (1990/1991 - 1994/1995), dan Gapura Wringin Lawang (1991/1992 - 1994/1995). Proses kegiatan pemugaran meliputi pembongkaran, perkuatan, pemasangan kembali (rekonstruksi), konservasi dan penataan lingkungan. Kegiatan ini dilaksanakan secara bertahap, terencana dan terpadu o1eh bidang tekno-arkeo1ogi, bidang konservasi dan bidang arkeologi. Sebelum dilakukan pemugaran di situs-situs Trowulan, terlebih dahulu dilakukan studi prapemugaran (studi kelayakan arkeologi dan studi teknis arkeologi). Kegiatan studi prapemugaran ini dilakukan dalam rangka penyusunan naskah Rencana Induk Arkeologi Bekas Kora Kerajaan Majapahit, yang telah diterbitkan pada tahun 1986.